這些工作還面臨一些根本性的質疑：很多人仍然不相信癌癥干細胞會以不同于其他腫瘤細胞的形式存在，而且一些人認為這些公司是在炒作，或至少是在過度強調其存在前提。如果臨床實驗取得一次成功，將可以減少一些爭議。“讓干細胞療法真正發揮效用，我認為所有研究癌癥干細胞療法的科研人員毋庸置疑都有相應的責任。”密歇根州立大學Ann Arbor說。elisa試劑盒
癌癥干細胞模型出現在上世紀90年代中期，當時加拿大多倫多大學細胞生物學家John Dick匯報稱，他的研究團隊從白血病患者血液中分離出罕見的細胞，該細胞可能在癌癥中發揮關鍵作用。盡管這些病人血液中的白細胞發生了畸變，但是只有少數人的血液在注入大鼠體內后會產生新的白血病。與成熟的血紅細胞不同，那些細胞看起來像是普通成年血紅細胞被錯誤誘導后的版本。和正常的干細胞一樣，癌癥干細胞同樣攜帶著不同的表面蛋白，并具備可再生性：它們可以分開并出一個常規癌細胞和一個新干細胞。
其他研究團隊隨后也報告稱在實體瘤如乳腺癌、結腸癌、腦癌、胰腺癌中發現明顯的癌癥干細胞。Dick和其他研究人員表示，這些細胞可能構成了1%~3%的多數實體瘤，并躲過了*和放射，部分上是因為大多數選擇性治療會迅速殺死分開的細胞，而癌癥干細胞比其他良性細胞生長得更慢。經過潛伏期后，這些癌癥干細胞隨后會重新生成原始腫瘤或是轉移到其他器官。
然而，這些研究也存在問題。科學家通常會通過區分具有特定表面蛋白的細胞——被認為是干細胞的標志——在實體瘤中挑選出癌癥干細胞。但是結果證明并非所有生成腫瘤的細胞都攜帶這種標記，而且構成大部分腫瘤的其他細胞有時也會攜帶這些表面蛋白。馬里蘭州巴爾迪莫約翰斯·霍普金斯大學癌癥干細胞研究人員William Matsui說，依賴這些標記將會“產生誤導”。elisa試劑盒
從21世紀頭10年末期開始，癌癥干細胞研究熱情已經激勵了美國國家癌癥研究所以及其他主要公司啟動旨在標記干細胞活躍通道的小規模藥物安全試驗。這里的目標通道是那些被稱為“音猬因子”的基因和切口家族基因控制的通道——以形成胚胎發育而為人所知。
現在已經結束的*藥物試驗結果令人沮喪。Matsui表示，這些藥物經常產生許多副作用，主要是由于它們損壞了正常干細胞，比如那些需要重新生成腸壁的干細胞。即便是這些副作用可以得到管理，對于大多數癌癥來說，這些藥物在大型研究中并未顯示出任何有效跡象。
