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推薦:RNA的制備

時(shí)間:2017/7/4閱讀:440
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一、mRNA的分離
  與rRNA和tRNA不同的是,哺乳動(dòng)物細(xì)胞的絕大部分mRNA在其3’端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纖維素親和層析法從大量的細(xì)胞RNA中分離mRNA。在構(gòu)建cdna文庫(kù)時(shí), 必須經(jīng)上述純化步驟制備mRNA模板。進(jìn)行Northern雜交或Sl 核酸酶作用圖分析時(shí),與總RNA相比,采用poly(A)+ RNA能獲得更為滿意的結(jié)果。 可以按照Gilham(1964)所述方法制備Oligo(dT)-纖維素,也可以買(mǎi)現(xiàn)成的產(chǎn)品。
1)用0.1mol/L NaOH懸浮0.5-1.0g 0ligo(dT)-纖維素。
2)將懸浮液裝入滅菌的一次性層析柱或裝入填有經(jīng)用DEPC處理并經(jīng)高壓滅菌的*的巴期德吸管中, 柱床體積為0.5-1.0ml,用3倍柱床體積滅菌水沖洗柱床。柱床體積為1m的oligo(dT)-纖維素zui大量為10mg總RNA,如果總RNA的量較少,則應(yīng)減少oligo(dT)-纖維素的使用量以防止poly(A)+RNA在過(guò)柱以及后續(xù)步驟中損失。
3)用無(wú)菌的1x層析柱加樣緩沖液沖洗柱床直至流出液的pH值小于8.0。1x層析柱加樣緩沖液
20mmol/L Tris.Cl(pH7.6)
0.5mol/L NaCl
1mmol/L EDTA(pH8.0)
0.1%SDS
可按以下方法制備滅菌的層析柱加樣緩沖液;將適量無(wú)rna酶的Tris. Cl(pH7.6)、氯化鈉和EDTA貯存液混合在15lbf/in2(1.034x105Pa)高壓下蒸氣滅菌,待其次序卻至65℃左右時(shí)加入已在65℃預(yù)熱30分鐘的10 %SDS貯存液。也可以用0.05mol/L檸檬酸鈉代替Tris.Cl 然后用DEPC處理檸檬鈉-NaCL-EDTA和SDS的混合溶液。
4)用滅菌水溶解RNA,于65℃溫育5分鐘后使迅速冷卻至室溫,加等體積的2x層析柱加樣緩沖液,上樣,立即用滅菌的試管收集洗液。 當(dāng)所的RNA溶液均進(jìn)入柱床后,加1倍體積的1x層析柱加樣 ,繼續(xù)收集洗出液。加熱RNA可以破壞可能涉及poly(A)尾的二級(jí)結(jié)構(gòu)。
5)當(dāng)全部溶液流出后,將收集液置于65℃溫育5分鐘,重新上樣,并收集流出液。
6)用5-10倍柱床體積的1x層析柱加樣緩沖液洗柱,分部收集洗出液,測(cè)定每一收集管的OD260。zui補(bǔ)由于不帶poly)A)的RNA洗過(guò)柱床, OD260會(huì)很高,后來(lái)OD260值則很小或?yàn)榱恪T谀承┓桨钢校鲜霾襟E后還用5倍柱術(shù)體積的含0.1mol/L NaCl的1x 層析柱加樣緩沖液洗柱床,然而由于洗出的不帶poly(A)的RNA很少甚至沒(méi)有, 因此這一步驟可以省略。
7)用2-3倍柱床體積的經(jīng)滅菌且無(wú)RNA酶的洗脫緩沖液洗脫mRNA,以1/3-1/2柱床體積分部收集洗脫液。洗脫緩沖液
10mmol/L Tris.Cl(pH7.6)
1mmol/L EDTA(pH8.0)
0.05%SDS

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